二氧化氯用於水產養殖包括氧化去除能力強、無殘留性、無抗藥性及增加溶氧等優點，分述如下：
另針對二氧化氯與氯消毒之比較如下
能分解有害物質，如鐵錳離子、硫化物與氰化物。
使用說明：
二氧化氯於水產養殖之應用包含空池水體消毒、魚苗繁殖池、室外養殖池、水質改善、致病的病源菌殺滅、有害有機物質分解、亞硝酸根迅速降低、剩餘飼料防腐發臭、底泥臭土味的去除、過量藻類生長抑制、活魚運輸及製冰等方向。
一般用於魚苗運輸、成魚運輸、養成管理、池底池壁消毒、空池水體消毒及製冰之濃度如下表所示，因養殖池中養殖種類不同、大小不同、水質條件不同，加上外界環境影響，故於養殖管理中二氧化氯使用量應依實際狀況增減。
註：因養殖池中養殖種類不同、大小不同、水質條件不同，加上外界環境影響，故於養殖管理中二氧化氯使用量應依實際狀況增減。
用藥量之多寡，應先針對各式不同水產養殖種類進行小規模藥劑測試，經不同濃度測試後，再訂定出最佳使用濃度。
